Έντονες αντιδράσεις και σοβαρά ερωτήματα έχει προκαλέσει η ανομοιόμορφη εφαρμογή του θεσμικού πλαισίου στις περασμένες κατατακτήριες εξετάσεις, αφήνοντας εκτός πανεπιστημιακών τμημάτων δεκάδες υποψηφίους. Παρά το γεγονός ότι πολλοί πτυχιούχοι συγκέντρωσαν τη συνολική βαθμολογία των 30 μονάδων που απαιτείται, βρέθηκαν αντιμέτωποι με τον αποκλεισμό επειδή ορισμένα τμήματα —όπως η Ιατρική Πατρών— εφάρμοσαν το επιπλέον κριτήριο της ελάχιστης βαθμολογίας του 10 σε κάθε μάθημα χωριστά. Το γεγονός αυτό οδήγησε στο να παραμείνουν δεκάδες θέσεις κενές, την ώρα που υποψήφιοι με υψηλές συνολικές βαθμολογίες απορρίφθηκαν, προκαλώντας αισθήματα βαθιάς αδικίας στους ενδιαφερόμενους.
Η κατάσταση περιπλέχθηκε περαιτέρω εξαιτίας της χρονολογικής αναντιστοιχίας και της ασάφειας στις οδηγίες της πολιτείας. Συγκεκριμένα, οι διευκρινιστικές εγκύκλιοι και η σχετική υπουργική απόφαση εκδόθηκαν τον Φεβρουάριο και τον Απρίλιο, δηλαδή μετά τη διεξαγωγή των εξετάσεων που πραγματοποιήθηκαν τον Δεκέμβριο. Η Πρωτοβουλία Υποψηφίων Κατατακτήριων Εξετάσεων καταγγέλλει πρωτοφανή αδικία και έλλειψη διαφάνειας, επισημαίνοντας ότι το υπουργείο αποφεύγει να δώσει ουσιαστικές απαντήσεις, ενώ ορισμένοι θιγόμενοι υποψήφιοι έχουν ήδη προχωρήσει σε νομικές ενέργειες κατά της άνισης μεταχείρισής τους.
Καταλυτική στην ανάδειξη του προβλήματος υπήρξε η παρέμβαση του Συνηγόρου του Πολίτη, ο οποίος στις αρχές Αυγούστου απέστειλε επιστολή στον υφυπουργό Παιδείας Νικόλαο Παπαϊωάννου. Η ανεξάρτητη αρχή, έπειτα από πληθώρα αναφορών, υπογράμμισε ότι το θεσμικό πλαίσιο ερμηνεύτηκε και εφαρμόστηκε χαοτικά από τα ΑΕΙ της χώρας, ακόμη και εντός των ίδιων ιδρυμάτων. Στην επιστολή επισημαίνεται το απαράδεκτο φαινόμενο κάποια τμήματα να δέχονται φοιτητές ανεξαρτήτως επίδοσης σε επιμέρους μαθήματα και άλλα να τους απορρίπτουν, ενώ καταγράφηκαν ακόμη και περιπτώσεις όπου επιτυχόντες διαγράφηκαν εκ των υστέρων από τις λίστες ως δήθεν εσφαλμένες εγγραφές.
Η πολιτική ηγεσία του Υπουργείου Παιδείας καλείται πλέον να δώσει εξηγήσεις για το διοικητικό αδιέξοδο και την έλλειψη ενιαίας γραμμής, την ώρα που οι υποψήφιοι αναμένουν με αγωνία μια θεσμική λύση. Η καθυστέρηση στον έγκαιρο ορισμό των κανόνων επέτρεψε στα πανεπιστημιακά τμήματα να λειτουργήσουν κατά το δοκούν, δημιουργώντας πολίτες δύο ταχυτήτων και αλλοιώνοντας τον κοινωνικό χαρακτήρα των κατατακτηρίων εξετάσεων που θεσπίστηκαν για να διευκολύνουν την πρόσβαση στην τριτοβάθμια εκπαίδευση.
